Может и не вырос существенно с 1861, но и явных предпосылок для значительного роста тоже не было. Рассмотрим для примера культурный слой окружающий Казанский собор. Шурф заложен у южной стены западной части здания в 2001 г:
Стратиграфия шурфа:
I. Асфальтовое покрытие с подсыпками и подстилающий их светло-коричневый насыпной слой. Общая мощность 0,4–0,5 м.
II. Булыжная отмостка с подстилающей песчаной подсыпкой, насыпные слои с прослойками кирпичной крошки и строительного мусора. Общая мощность 0,5–0,6 м.
III. Слой раствора со щебнем, образовавшийся в результате разравнивания строительных остатков после завершения нулевого цикла строительных работ в 1803 г. Мощность 0,25–0,3 м.Уклон с севера на юг.
IV. Слой песка мощностью 0,4–0,5 м; предположительно, выброс при копке фундаментного рва или подсыпка.
V. Однородный влажный слой песка, переходящего в суглинок. Включения линз и прослоек кирпичной крошки, камней, битого кирпича. По южной стенке прослежены локальные перекопы, заполненные раствором и щебнем.
Сопоставление стратиграфических наблюдений с историко-архивными данными позволяет выделить и датировать этапы нулевого строительного цикла:
Что мы можем извлечь из этих описаний? С начала 19-го века (период 1811-1818), когда была сооружена мостовая у собора и вплоть до наших дней, культурной слой вырос на 40-50 см за счет асфальта и подложки под него, перекрывшего булыжную мостовую. Всё, более никаких причин для роста культурного слоя не было. Оно и понятно. Но ранее начала строительства собора, культурный слой имеет значительную мощность - за счёт строительных нивелировочных подсыпок, повышения уровня набережной Екатерининского канала под восточное крыло колоннады и т.п. работы.
К примеру, на Дворцовой, при реконструкциях площади, старое покрытие демонтировалось и вывозилось, а на его место стелилось новое полотно:
1932, снята старая брусчатка и взамен её уложен асфальт:
1977 год - асфальт снят и взамен его положена брусчатка:
Каким образом там может вырасти культурный слой после строительства дворца? Тут вообще никаких предпосылок. Но так делали(ют) не всегда и не везде.
Вероятно, наиболее интенсивно поднимали город подсыпками в течении 18-го века - основная мощность культурного слоя Петербурга должна быть в этот период, как и возвышения улиц относительно домов (хотя опять же нужно рассматривать историю застройки каждого района).
ПС
Про раскопки на Миллионной не могу пока найти инфу, а было бы интересно почитать.